تعمل وكالة كلية الطب للدراسات العليا والبحث العلمي على دعم واستمرارية تميز كلية الطب في مجال الدراسات العليا والزمالات الطبية، والمنافسة العالمية في مجال البحث والتطوير والابتكار. كما تقدم الوكالة الدعم لأعضاء هيئة التدريس والمعيدين والمحاضرين والباحثين لتعزيز قدراتهم الأكاديمية والبحثية، ومواصلة تطورهم المهني. وتشرف الوكالة على مراكز الأبحاث وكراسي البحث بالكلية، وتقدم الدعم لها في سبيل تحقيق أهدافها ومواصلة تميزها. كما توفر الوكالة البيئة المناسبة لأعضاء هيئة التدريس والطلبة الباحثين للقيام بأبحاثهم، وتدعم الوكالة التعاون البحثي بين التخصصات المختلفة من داخل وخارج الجامعة. كما تهتم الوكالة بالمشاركة المجتمعية لتحقيق مستهدفات الرؤية في مجال المسؤولية المجتمعية، وتقوم بتأسيس ورعاية الاتفاقيات العلمية مع الجامعات والمراكز المحلية والعالمية لدعم مخرجات الكلية في البحث العلمي، وتعزيز تميزها في مجال الابتكار وريادة الاعمال.