تعنى وكالة كلية الطب للتطوير والجودة بالتخطيط والإدارة والقيادة لعمليات التطوير والجودة وتطبيقاتها، وتحقيق معايير الاعتماد والتقويم الأكاديمي في العملية التعليمية والأكاديمية في الأقسام الأكاديمية، وضبط نظام الجودة في العمل الإداري داخل الكلية، والعمل على تطوير وتحسين الأداء في كافة الجوانب ونشر ثقافتها. وتسعى الوكالة الى تحديث وتطوير برنامج كلية الطب والتركيز على مخرجات التعلم وقياسها ووضع مؤشرات لقياس الآداء حتى نصل الى رؤية الكلية لتحقيق التميز والريادة في التعليم الطبي والبحث العلمي والشراكة المجتمعية.