تأسست وحدة الدراسات العليا بتاريخ 14/02/1442هـ، وهي تتبع وكالة الدراسات العليا والبحث العلمي، وتشرف الوحدة على برامج الدراسات العليا التي صممت كبرامج مشتركة بين التخصصات الطبية والصحية لاستقطاب الأكاديميين والمعلمين الإكلينيكيين من كافة التخصصات الطبية والمهن الصحية، وذلك لتلبية احتياجات مؤسسات التعليم والتدريب الطبي (وطلابها) لزيادة القدرة على التعليم الطبي والممارسة السريرية والبحث العلمي.