تتمثل مهمة قسم علم وظائف الأعضاء في تحقيق بعض أهداف رؤية المملكة العربية السعودية 2030 وذلك من خلال اجراء أبحاث طبية ذات مستوى عالمي وتقديم الدرجات العلمية العالية المبنية على التعليم الحديث بأعلى المعايير الدولية لتخريج طلاب ذوي مخرجات عالية وممتازة تمكنهم من تقديم أفضل خدمات الرعاية الصحية لمجتمعنا وللخارج.
وانسجامًا مع رسالة كلية الطب بجامعة الملك سعود ، يلتزم قسم علم وظائف الأعضاء أيضًا بالأنشطة البحثية الموجهة لحل المشكلات الصحية المتعلقة بالمجتمع السعودي ككل.